Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3eP60229 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3eP60229 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms