Protein–RNA interactions for Protein: P59280

Klhl8, Kelch-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl8P59280 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl8P59280 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl8P59280 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl8P59280 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl8P59280 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl8P59280 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl8P59280 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl8P59280 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms