Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp5P56399 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp5P56399 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp5P56399 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp5P56399 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp5P56399 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp5P56399 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp5P56399 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp5P56399 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp5P56399 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp5P56399 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp5P56399 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms