Protein–RNA interactions for Protein: P55302

Lrpap1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrpap1P55302 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrpap1P55302 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrpap1P55302 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrpap1P55302 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrpap1P55302 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms