Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmod1P49813 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmod1P49813 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmod1P49813 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmod1P49813 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms