Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atoh1P48985 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Atoh1P48985 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atoh1P48985 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms