Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brca1P48754 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brca1P48754 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brca1P48754 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brca1P48754 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brca1P48754 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca1P48754 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brca1P48754 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brca1P48754 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brca1P48754 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Brca1P48754 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brca1P48754 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brca1P48754 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms