Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a2P43006 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc1a2P43006 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a2P43006 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms