Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.66□□□□□ -1.18
VID28P40547 YKL102CYKL102C 306 nt7.66□□□□□ -1.18
VID28P40547 YNL092WYNL092W 1203 nt7.66□□□□□ -1.18
VID28P40547 TMA46YOR091W 1038 nt7.66□□□□□ -1.18
VID28P40547 MRPL23YOR150W 492 nt7.66□□□□□ -1.18
VID28P40547 PPH22YDL188C 1134 nt7.65□□□□□ -1.18
VID28P40547 HEM2YGL040C 1029 nt7.65□□□□□ -1.18
VID28P40547 DID2YKR035W-A 615 nt7.65□□□□□ -1.18
VID28P40547 YNL165WYNL165W 1221 nt7.65□□□□□ -1.18
VID28P40547 YOR389WYOR389W 1875 nt7.64□□□□□ -1.19
VID28P40547 LCL3YGL085W 825 nt7.64□□□□□ -1.19
VID28P40547 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.64□□□□□ -1.19
VID28P40547 PEX31YGR004W 1389 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 GPD1YDL022W 1176 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 POR2YIL114C 846 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 COX16YJL003W 357 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 ASF1YJL115W 840 nt7.63□□□□□ -1.19
VID28P40547 MRPL35YDR322W 1104 nt7.62□□□□□ -1.19
VID28P40547 DFR1YOR236W 636 nt7.62□□□□□ -1.19
VID28P40547 REG2YBR050C 1017 nt7.62□□□□□ -1.19
VID28P40547 EDC3YEL015W 1656 nt7.62□□□□□ -1.19
VID28P40547 DYS1YHR068W 1164 nt7.61□□□□□ -1.19
VID28P40547 FMO1YHR176W 1299 nt7.61□□□□□ -1.19
VID28P40547 PPM2YOL141W 2088 nt7.61□□□□□ -1.19
VID28P40547 SAL1YNL083W 1485 nt7.6□□□□□ -1.19
VID28P40547 ICL2YPR006C 1728 nt7.59□□□□□ -1.19
VID28P40547 RPL5YPL131W 894 nt7.59□□□□□ -1.19
VID28P40547 TRR1YDR353W 960 nt7.58□□□□□ -1.2
VID28P40547 SPG1YGR236C 288 nt7.58□□□□□ -1.2
VID28P40547 RNH1YMR234W 1047 nt7.58□□□□□ -1.2
VID28P40547 TOS6YNL300W 309 nt7.58□□□□□ -1.2
VID28P40547 RQC1YDR333C 2172 nt7.58□□□□□ -1.2
VID28P40547 TAF9YMR236W 474 nt7.56□□□□□ -1.2
VID28P40547 ILV6YCL009C 930 nt7.56□□□□□ -1.2
VID28P40547 HEM1YDR232W 1647 nt7.56□□□□□ -1.2
VID28P40547 PMP3YDR276C 168 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 HIS1YER055C 894 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 YJL211CYJL211C 444 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 MIA40YKL195W 1212 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 GCN3YKR026C 918 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 COX10YPL172C 1389 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 YPL277CYPL277C 1464 nt7.55□□□□□ -1.2
VID28P40547 YKR023WYKR023W 1593 nt7.54□□□□□ -1.2
VID28P40547 GPD2YOL059W 1323 nt7.54□□□□□ -1.2
VID28P40547 RFC4YOL094C 972 nt7.54□□□□□ -1.2
VID28P40547 ECM27YJR106W 2178 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 GAL83YER027C 1254 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 YRB2YIL063C 984 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 YHM2YMR241W 945 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 MRPS18YNL306W 654 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 YPR204WYPR204W 3099 nt7.53□□□□□ -1.2
VID28P40547 EDE1YBL047C 4146 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YDR415CYDR415C 1125 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 GCG1YER163C 699 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 ATG36YJL185C 882 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YJR107WYJR107W 987 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 OPI8YKR035C 642 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YKR045CYKR045C 552 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 TSR2YLR435W 618 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YBL112CYBL112C 318 nt7.52□□□□□ -1.21
VID28P40547 YPT1YFL038C 621 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 YJR146WYJR146W 354 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 CUE4YML101C 354 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 YNL120CYNL120C 486 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 OPI11YPR044C 354 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 YHK8YHR048W 1545 nt7.51□□□□□ -1.21
VID28P40547 CCT8YJL008C 1707 nt7.5□□□□□ -1.21
VID28P40547 RBS1YDL189W 1374 nt7.5□□□□□ -1.21
VID28P40547 EEB1YPL095C 1371 nt7.5□□□□□ -1.21
VID28P40547 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.5□□□□□ -1.21
VID28P40547 YAR064WYAR064W 300 nt7.5□□□□□ -1.21
VID28P40547 ERG8YMR220W 1356 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 YGR054WYGR054W 1929 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 MAK32YCR019W 1092 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 FBA1YKL060C 1080 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 YKL153WYKL153W 510 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 SWP1YMR149W 861 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 YPL257WYPL257W 582 nt7.49□□□□□ -1.21
VID28P40547 OM45YIL136W 1182 nt7.48□□□□□ -1.21
VID28P40547 AIM20YIL158W 615 nt7.48□□□□□ -1.21
VID28P40547 MHT1YLL062C 975 nt7.48□□□□□ -1.21
VID28P40547 CTF19YPL018W 1110 nt7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.2 ms