Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd9P40240 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd9P40240 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd9P40240 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd9P40240 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd9P40240 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd9P40240 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd9P40240 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd9P40240 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd9P40240 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms