Protein–RNA interactions for Protein: P38772

BCD1, Box C/D snoRNA protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BCD1P38772 AFG2YLR397C 2343 nt7.39□□□□□ -1.23
BCD1P38772 CDC16YKL022C 2523 nt7.38□□□□□ -1.23
BCD1P38772 PPH21YDL134C 1110 nt7.38□□□□□ -1.23
BCD1P38772 IRC11YOR013W 471 nt7.38□□□□□ -1.23
BCD1P38772 YHR020WYHR020W 2067 nt7.38□□□□□ -1.23
BCD1P38772 PPM2YOL141W 2088 nt7.38□□□□□ -1.23
BCD1P38772 BIO3YNR058W 1443 nt7.37□□□□□ -1.23
BCD1P38772 YLL066CYLL066C 3618 nt7.37□□□□□ -1.23
BCD1P38772 DYS1YHR068W 1164 nt7.37□□□□□ -1.23
BCD1P38772 LDB7YBL006C 543 nt7.37□□□□□ -1.23
BCD1P38772 RPL5YPL131W 894 nt7.37□□□□□ -1.23
BCD1P38772 PEX31YGR004W 1389 nt7.36□□□□□ -1.23
BCD1P38772 PPH22YDL188C 1134 nt7.36□□□□□ -1.23
BCD1P38772 ATG36YJL185C 882 nt7.36□□□□□ -1.23
BCD1P38772 YNL092WYNL092W 1203 nt7.36□□□□□ -1.23
BCD1P38772 FCY22YER060W-A 1593 nt7.35□□□□□ -1.23
BCD1P38772 BMT5YIL096C 1011 nt7.35□□□□□ -1.23
BCD1P38772 TMA46YOR091W 1038 nt7.35□□□□□ -1.23
BCD1P38772 OPI11YPR044C 354 nt7.35□□□□□ -1.23
BCD1P38772 DOT1YDR440W 1749 nt7.35□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 ASR1YPR093C 867 nt7.34□□□□□ -1.23
BCD1P38772 SLA2YNL243W 2907 nt7.34□□□□□ -1.24
BCD1P38772 MPH3YJR160C 1809 nt7.34□□□□□ -1.24
BCD1P38772 TOS6YNL300W 309 nt7.33□□□□□ -1.24
BCD1P38772 ADH5YBR145W 1056 nt7.33□□□□□ -1.24
BCD1P38772 PLB3YOL011W 2061 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 STT3YGL022W 2157 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YJR107WYJR107W 987 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 GCN3YKR026C 918 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 SWD1YAR003W 1281 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 AAD14YNL331C 1131 nt7.32□□□□□ -1.24
BCD1P38772 HOC1YJR075W 1191 nt7.31□□□□□ -1.24
BCD1P38772 COQ1YBR003W 1422 nt7.31□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YPL071CYPL071C 471 nt7.31□□□□□ -1.24
BCD1P38772 HXT13YEL069C 1695 nt7.31□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YNL017CYNL017C 339 nt7.3□□□□□ -1.24
BCD1P38772 FMP40YPL222W 2067 nt7.3□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YOR389WYOR389W 1875 nt7.3□□□□□ -1.24
BCD1P38772 COX15YER141W 1461 nt7.3□□□□□ -1.24
BCD1P38772 SSC1YJR045C 1965 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 CMK2YOL016C 1344 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 MRPL35YDR322W 1104 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YDR415CYDR415C 1125 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YPT1YFL038C 621 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YKL102CYKL102C 306 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YNL165WYNL165W 1221 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 PUS4YNL292W 1212 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 EDE1YBL047C 4146 nt7.29□□□□□ -1.24
BCD1P38772 CYS4YGR155W 1524 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 YJL144WYJL144W 315 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 LIA1YJR070C 978 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 OPI8YKR035C 642 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 CUE4YML101C 354 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 RRN10YBL025W 438 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 SMK1YPR054W 1167 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 MSB3YNL293W 1902 nt7.28□□□□□ -1.24
BCD1P38772 HEM1YDR232W 1647 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 POX1YGL205W 2247 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 GPD1YDL022W 1176 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 YKL077WYKL077W 1179 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 SWP1YMR149W 861 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 CRH1YGR189C 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
BCD1P38772 HSP12YFL014W 330 nt7.26□□□□□ -1.25
BCD1P38772 RRP46YGR095C 672 nt7.26□□□□□ -1.25
BCD1P38772 HEL1YKR017C 1656 nt7.25□□□□□ -1.25
BCD1P38772 HIS1YER055C 894 nt7.25□□□□□ -1.25
BCD1P38772 RFC4YOL094C 972 nt7.25□□□□□ -1.25
BCD1P38772 LSC1YOR142W 990 nt7.25□□□□□ -1.25
BCD1P38772 MRPL23YOR150W 492 nt7.25□□□□□ -1.25
BCD1P38772 COX10YPL172C 1389 nt7.24□□□□□ -1.25
BCD1P38772 KSH1YNL024C-A 219 nt7.24□□□□□ -1.25
BCD1P38772 CCC2YDR270W 3015 nt7.24□□□□□ -1.25
BCD1P38772 UTP6YDR449C 1323 nt7.24□□□□□ -1.25
BCD1P38772 MIP1YOR330C 3765 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 YOS9YDR057W 1629 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 HEM2YGL040C 1029 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 MIA40YKL195W 1212 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 YKR032WYKR032W 315 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 RNH1YMR234W 1047 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 ATP4YPL078C 735 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 RGT2YDL138W 2292 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 GDA1YEL042W 1557 nt7.23□□□□□ -1.25
BCD1P38772 PRY3YJL078C 2646 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.4 ms