Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VtnP29788 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VtnP29788 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VtnP29788 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VtnP29788 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VtnP29788 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VtnP29788 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VtnP29788 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VtnP29788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VtnP29788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VtnP29788 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VtnP29788 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VtnP29788 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VtnP29788 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VtnP29788 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VtnP29788 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VtnP29788 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VtnP29788 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VtnP29788 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VtnP29788 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VtnP29788 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VtnP29788 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VtnP29788 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VtnP29788 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VtnP29788 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VtnP29788 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VtnP29788 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VtnP29788 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VtnP29788 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VtnP29788 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VtnP29788 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VtnP29788 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VtnP29788 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VtnP29788 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VtnP29788 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VtnP29788 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms