Protein–RNA interactions for Protein: P27344

DPB3, DNA polymerase epsilon subunit C, yeastyeast

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB3P27344 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YJL144WYJL144W 315 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YJR107WYJR107W 987 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 GCN3YKR026C 918 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 AVO2YMR068W 1281 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YMR027WYMR027W 1413 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 VTS1YOR359W 1572 nt7.33□□□□□ -1.24
DPB3P27344 FPR2YDR519W 408 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB3P27344 CUE4YML101C 354 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB3P27344 PLB2YMR006C 2121 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB3P27344 ATP23YNR020C 813 nt7.32□□□□□ -1.24
DPB3P27344 ACO1YLR304C 2337 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB3P27344 RPL31BYLR406C 342 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB3P27344 SLD7YOR060C 774 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB3P27344 BRN1YBL097W 2265 nt7.31□□□□□ -1.24
DPB3P27344 NAF1YNL124W 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YDL177CYDL177C 513 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 MED6YHR058C 888 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 REC107YJR021C 945 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YBL070CYBL070C 321 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 TFB4YPR056W 1017 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 SKI2YLR398C 3864 nt7.3□□□□□ -1.24
DPB3P27344 ERG12YMR208W 1332 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB3P27344 IES1YFL013C 2079 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YIA6YIL006W 1122 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB3P27344 TOS6YNL300W 309 nt7.29□□□□□ -1.24
DPB3P27344 PHO3YBR092C 1404 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB3P27344 HIS1YER055C 894 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB3P27344 FUS3YBL016W 1062 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB3P27344 IRC11YOR013W 471 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YPR130CYPR130C 408 nt7.28□□□□□ -1.24
DPB3P27344 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SPG5YMR191W 1122 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB3P27344 GET4YOR164C 939 nt7.27□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YDR415CYDR415C 1125 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 GTT3YEL017W 1014 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 PTC7YHR076W 1032 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YLR358CYLR358C 564 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 ECM30YLR436C 3825 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 NTG2YOL043C 1143 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 DFR1YOR236W 636 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 VBA5YKR105C 1749 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 JIP4YDR475C 2631 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 DML1YMR211W 1428 nt7.26□□□□□ -1.25
DPB3P27344 PET494YNR045W 1470 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 IRS4YKR019C 1848 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YSC83YHR017W 1158 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YKR032WYKR032W 315 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 AIM33YML087C 939 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 HSM3YBR272C 1443 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YMR034CYMR034C 1305 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 GLN3YER040W 2193 nt7.25□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.24□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YNR005CYNR005C 405 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB3P27344 HEM1YDR232W 1647 nt7.23□□□□□ -1.25
DPB3P27344 MIP1YOR330C 3765 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SES1YDR023W 1389 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YPT1YFL038C 621 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB3P27344 YGR139WYGR139W 339 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB3P27344 MSS116YDR194C 1995 nt7.22□□□□□ -1.25
DPB3P27344 DEF1YKL054C 2217 nt7.21□□□□□ -1.25
DPB3P27344 SGE1YPR198W 1632 nt7.21□□□□□ -1.26
DPB3P27344 CIA1YDR267C 993 nt7.21□□□□□ -1.26
DPB3P27344 MRPS28YDR337W 861 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 SOD2YHR008C 702 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 COX5AYNL052W 462 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 PAU21YOR394W 495 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 PAU22YPL282C 495 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 RSC2YLR357W 2670 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 YHR020WYHR020W 2067 nt7.2□□□□□ -1.26
DPB3P27344 TOS2YGR221C 1869 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB3P27344 ARG81YML099C 2643 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB3P27344 HTZ1YOL012C 405 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB3P27344 BNA5YLR231C 1362 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB3P27344 YPR204WYPR204W 3099 nt7.19□□□□□ -1.26
DPB3P27344 PDA1YER178W 1263 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB3P27344 CBT1YKL208W 816 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB3P27344 PPM2YOL141W 2088 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB3P27344 STT3YGL022W 2157 nt7.18□□□□□ -1.26
DPB3P27344 RDL2YOR286W 450 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB3P27344 SMX3YPR182W 261 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB3P27344 RPO26YPR187W 468 nt7.17□□□□□ -1.26
DPB3P27344 YLL058WYLL058W 1728 nt7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.5 ms