Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxb9P20615 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxb9P20615 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb9P20615 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb9P20615 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms