Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl13aP19253 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl13aP19253 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms