Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phka1P18826 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phka1P18826 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phka1P18826 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phka1P18826 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Phka1P18826 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Phka1P18826 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phka1P18826 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phka1P18826 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phka1P18826 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phka1P18826 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phka1P18826 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phka1P18826 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms