Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca3P16015 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca3P16015 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca3P16015 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca3P16015 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca3P16015 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca3P16015 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca3P16015 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ca3P16015 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ca3P16015 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca3P16015 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca3P16015 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca3P16015 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms