Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmnb1P14733 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Lmnb1P14733 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmnb1P14733 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmnb1P14733 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmnb1P14733 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms