Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msh3P13705 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh3P13705 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msh3P13705 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msh3P13705 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh3P13705 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msh3P13705 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh3P13705 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh3P13705 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh3P13705 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Msh3P13705 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh3P13705 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh3P13705 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms