Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Vpreb1P13372 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Vpreb1P13372 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vpreb1P13372 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms