Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd4P10628 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd4P10628 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd4P10628 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms