Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Amd1P0DMN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Amd1P0DMN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Amd1P0DMN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms