Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd3P09027 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd3P09027 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd3P09027 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms