Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P06324 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P06324 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P06324 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P06324 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P06324 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P06324 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P06324 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P06324 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P06324 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P06324 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P06324 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P06324 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P06324 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P06324 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P06324 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P06324 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P06324 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P06324 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P06324 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P06324 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P06324 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P06324 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P06324 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P06324 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P06324 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P06324 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P06324 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06324 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P06324 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
P06324 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
P06324 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P06324 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P06324 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P06324 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P06324 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P06324 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P06324 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P06324 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P06324 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P06324 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P06324 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P06324 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P06324 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P06324 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P06324 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P06324 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P06324 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P06324 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P06324 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P06324 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P06324 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms