Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01745 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01745 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01745 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01745 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01745 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01745 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01745 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01745 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01745 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01745 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01745 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01745 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01745 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01745 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01745 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01745 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01745 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01745 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01745 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01745 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01745 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01745 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01745 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01745 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01745 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01745 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01745 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01745 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01745 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01745 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01745 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01745 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01745 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01745 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01745 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01745 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01745 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms