Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01735 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01735 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01735 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01735 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01735 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01735 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01735 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01735 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01735 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01735 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P01735 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01735 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01735 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01735 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01735 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01735 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01735 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01735 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01735 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01735 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01735 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01735 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01735 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01735 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01735 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01735 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01735 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01735 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01735 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01735 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01735 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01735 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01735 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01735 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01735 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01735 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01735 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01735 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01735 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01735 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01735 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01735 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01735 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01735 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01735 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01735 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms