Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01672 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01672 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01672 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01672 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01672 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01672 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01672 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01672 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01672 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01672 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01672 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01672 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01672 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01672 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01672 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01672 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01672 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01672 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
P01672 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01672 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01672 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01672 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01672 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01672 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01672 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01672 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01672 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01672 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01672 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01672 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01672 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01672 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01672 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01672 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01672 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01672 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01672 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01672 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01672 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01672 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01672 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01672 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01672 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01672 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01672 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01672 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01672 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01672 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01672 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01672 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01672 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01672 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01672 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01672 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01672 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms