Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2bO89051 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2bO89051 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itm2bO89051 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2bO89051 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms