Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shoc2O88520 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shoc2O88520 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shoc2O88520 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 552.9 ms