Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna4O70174 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna4O70174 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna4O70174 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna4O70174 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.6 ms