Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rad51dO55230 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad51dO55230 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad51dO55230 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms