Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scarb2O35114 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarb2O35114 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarb2O35114 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarb2O35114 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.2 ms