Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Q1O19441 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q1O19441 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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H2-Q1O19441 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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H2-Q1O19441 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Q1O19441 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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H2-Q1O19441 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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H2-Q1O19441 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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H2-Q1O19441 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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H2-Q1O19441 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Q1O19441 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Q1O19441 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms