Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncoa3O09000 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncoa3O09000 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncoa3O09000 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncoa3O09000 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncoa3O09000 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ncoa3O09000 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms