Protein–RNA interactions for Protein: O08901

Bub1, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bub1O08901 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bub1O08901 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bub1O08901 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bub1O08901 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bub1O08901 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Bub1O08901 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bub1O08901 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bub1O08901 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bub1O08901 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bub1O08901 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bub1O08901 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bub1O08901 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bub1O08901 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms