Protein–RNA interactions for Protein: O08586

Pten, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtenO08586 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtenO08586 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtenO08586 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtenO08586 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtenO08586 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtenO08586 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtenO08586 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtenO08586 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtenO08586 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtenO08586 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtenO08586 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtenO08586 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtenO08586 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtenO08586 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtenO08586 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtenO08586 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtenO08586 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtenO08586 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtenO08586 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtenO08586 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtenO08586 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtenO08586 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtenO08586 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtenO08586 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtenO08586 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtenO08586 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtenO08586 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtenO08586 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtenO08586 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtenO08586 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtenO08586 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtenO08586 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtenO08586 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtenO08586 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtenO08586 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtenO08586 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtenO08586 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtenO08586 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtenO08586 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtenO08586 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtenO08586 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtenO08586 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtenO08586 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtenO08586 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtenO08586 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtenO08586 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtenO08586 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtenO08586 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtenO08586 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtenO08586 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtenO08586 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtenO08586 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtenO08586 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtenO08586 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtenO08586 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtenO08586 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtenO08586 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtenO08586 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtenO08586 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtenO08586 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtenO08586 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtenO08586 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms