Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E5

Vmn2r39, Vomeronasal 2, receptor 39, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r39L7N2E5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r39L7N2E5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn2r39L7N2E5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r39L7N2E5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r39L7N2E5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r39L7N2E5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms