Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3453K7N724 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3453K7N724 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3453K7N724 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 997.7 ms