Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3383J3QQ59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3383J3QQ59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3383J3QQ59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm3383J3QQ59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms