Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim18J3QNP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim18J3QNP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim18J3QNP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms