Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Ccdc180J3QNE4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ccdc180J3QNE4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc180J3QNE4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc180J3QNE4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Ccdc180J3QNE4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 655.3 ms