Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A630095N17RikJ3KMM7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A630095N17RikJ3KMM7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A630095N17RikJ3KMM7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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