Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r194J3JS27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r194J3JS27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r194J3JS27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r194J3JS27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms