Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4lG5E8X2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4lG5E8X2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc4lG5E8X2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pabpc4lG5E8X2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms