Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmigd3G3X8R9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmigd3G3X8R9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmigd3G3X8R9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmigd3G3X8R9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms