Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20509G3UZF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20509G3UZF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm20509G3UZF1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20509G3UZF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms