Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm28048F7BCN0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28048F7BCN0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28048F7BCN0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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