Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610001J05RikF2Z3Y9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms