Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc141E9Q8Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc141E9Q8Q6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc141E9Q8Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc141E9Q8Q6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc141E9Q8Q6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc141E9Q8Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc141E9Q8Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms