Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC051665E9Q623 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC051665E9Q623 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC051665E9Q623 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC051665E9Q623 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms